Dates

Du 17 au 18 Janvier 2018.

Lieu

Institut de Mathématiques de Toulouse, Amphithéâtre Laurent Schwartz, Bâtiment 1R3

Description

Il s'agit de poursuivre une série de rencontres entre les scientifiques aussi bien dans le cadre de leur activité de recherche méthodologique que, sur le plan opérationnel, de l'exploitation des données par la mise œuvre ou le développement d'outils bioinformatiques/biostatistiques appropriés. Cet évènement regroupe les journées Genotou et un workshop organisé dans le cadre du projet européen ONCONET SUDOE.

L'ensemble des chercheurs et ingénieurs en région (organismes publics et entreprises privées) sont invités à proposer une présentation sous forme d'un résumé (1 à 2 pages) pour une contribution orale ou par affiche. Cette journée sera aussi l'occasion de présenter rapidement les missions et les actualités des plateformes de biostatistique et de bioinformatique.

Mots clés

Bioinformatique, Biostatistiques

Programme

Mardi 16/01/17                    
14h-17h    Onconet Sudoe Technical meeting                
                    
Mercredi 17/01/17                    

8h30-9h15    Accueil café                
9h15-9h30    Introduction                
9h30-10h30    Conférence invité : Marie-Laure Martin-Magniette (Inra, AgroParisTech), Inférence de réseaux biologiques à partir de données transcriptomiques
10h30-11h    Pause café                 
11h-12h30    Communications « Onconet Sudoe »                
            Franklin Delehelle (Irit), ASGART – The hunt for duplications
            Hector Tejero (CNIO), Predicting cancer sequential treatments  and drug repurposing  with SATIE
            Jordi Martorell Marugán (GENYO), mCSEA: An R package for detection of differentially methylated regions
            Alberto Labarga Gutierrez (NavarraBiomed), Stategra: Development of new statistical methods and tools for genomic technologies

12h30-14h    Repas buffet                
                    
14h-15h30    Communications (*3)                
            Guillaume Devailly (GenPhySE) , scFeatureFilter: an R package for non-arbitrary feature filtering in single cell RNA-seq experiments
            Sébastien Déjean (IMT), New developments of the mixOmics R package for the exploration and the integration of biological data sets
            Olivier Chapleur (Irstea), Development of microbial indicators of anaerobic digestion inhibition with omics data integration

15h30-16h    Pause Café                

16h-17h30    Communications (*3)                
            Willy Rodriguez (IMT), Challenges when applying stochastic models to reconstruct the demographic history populations
            Nicolas Nafati (Inserm), Algorithm based on a Multiple  and  Binary  Logistic  Regression  (MBLR)  model for pregnancy prediction
            Alexandra Mancheno Ferris (CBI), Bioinformatic analyses of targets of the Shavenbaby Transcription Factor

18h30    Conférence grand-public                
    Grand amphi de médecine, allées Jules Guesde                
                    
Jeudi 18/01/17

9h-10h    Conférence invité : Jean-François Deleuze (Directeur du Centre National de Recherche en Génomique Humaine), NGS de la recherche au plan de médecine génomique FMG2025

10h-10h30    Pause café                 

10h30-12h30    Communications (*4)                
            Raphael Mourad (CBI), Predicting double-strand DNA breaks using epigenome marks or DNA at kilobase resolution
            Cécilia Berges (Métatoul), Jérôme Fehrenbach (IMT), When industrial monitoring software meets biological data
            Sabine Mercier (IMT), Atypical segment detection in biological sequences: A methodological approach for the local score distribution
            Ludovic Cottret (LIPM), Comparaison des réseaux métaboliques de bactéries phytopathogènes

12h30-14h    Repas buffet                

13h30-14h30     Session poster                

14h30-16h    Communications (*3)                
            Benoît Augé (CBD), Transcriptional regulation of haematopoiesis by GATA and FOG transcription factor in Drosophila
            Camille Champion (Inserm), Discovery of metagenomic biomarkers for the development of a diabete 2 related disease
            Gaëlle Lefort (Inra), Using ASICS to quantify metabolites in 1D 1H NMR spectra: an application to perinatal survival in pigs

16h-16h15    Cloture café                 

Les inscriptions sont gratuites mais obligatoires. Les pauses et repas de midi seront pris en charge. / Registration is free but mandatory. Coffee breaks and lunch are supported by the organization.

Steering committee

Sébastien Déjean (UPS IMT), Christine Gaspin (Inra MIAT), Sandrine Laguerre (Inra LISBP), Hervé Luga (UT2 IRIT), Matthias Zytnicki (Inra MIAT).